地名由来：“子里甲”系怒语，意为大樱桃树坪。“子”即大，“里”是樱桃树，“甲”即小平地。因该地有一片大樱桃树且地势稍平而名。

2021年3月，子里甲乡入选2020年云南省卫生乡镇名单。

福贡县辖乡。1932年设碧江设治局嘉禾乡，1959年建前进公社，1965年更名子里甲公社，1986年碧江县建制撤销，划归?福贡县，1988年改乡。位于县城南，距县城24公里。面积351平方公里，人口0.8万。瓦贡公路过境。辖子里甲、俄科罗、腊母甲、金秀谷、亚谷5个行政村。农业以种植玉米、水稻、旱稻为主。

历史沿革：

民国二十一年（1932年），设碧江设治局。

1986年，撤销碧江建制，子里甲区划属福贡县。

1988年，设福贡县子里甲乡。